Código PPCF021 - Bioinformática Básica.pdf
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                    UNIVERSIDADE FEDERAL DE ALAGOAS
ESCOLA DE ENFERMAGEM E FARMÁCIA
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIAS FARMACÊUTICAS

DISCIPLINA OFERTADA
INFORMAÇÕES ACADÊMICAS

Disciplina: Bioinformática Básica
Código: PPCF021
Obrigatória: Não
Carga Horária: 45
Créditos: 3
Ementa: Introdução à bioinformática, ferramentas de software, formatos de arquivos
relacionados a bioinformática, bancos de dados na rede, buscas por similaridade, domínios
conservados, alinhamento de sequências, ortologia, filogenia e árvores filogenéticas. Objetivo
Ensinar conceitos básicos de bioinformática para uso de programas diversos disponíveis como
serviços na web. Conteúdo programático - Conceitos básicos de um computador (hardware,
sistema operacional e programas) e de biologia molecular (estrutura DNA, tradução, frames
de leitura, e domínios conservados). - Formatos relacionados a bioinformática (FASTA e
Genbank); - Bancos de dados no NCBI: PUBMED, Livros, Proteínas - Buscas por
similaridade: Matrizes de score à Família Blast de programas Matrizes - Domínios
conservados, bancos de dados e arquitetura de domínios - Alinhamento de sequências: Local
x global, simples x múltiplo, parâmetros e matrizes de comparação. Avaliação de qualidade
em alinhamentos. - Ortologia, paralogia, homologia e similaridade: Bancos de dados de
clusters de ortólogos: COG, KOG, KEGG. Identificação de ortólogos e de vias metabólicas
no KEGG. - Filogenia e dendogramas: Bases da filogenia, métodos de matrizes de distância,
máxima parcimônia e probabilidade, inferência bayesiana e seleção de modelo. Construção de
árvores com e sem raiz.
Bibliografia:
• Introduction to Bioinformatics. Lesk, AM. Oxford. 3rd edition, 2008.
• Developing bioinformatics computer skills, Gibas e Jambeck. O’Reilly. 2001.
• Bioinformatics – A practical guide to the analysis of genes and proteins. Baxevanis,
AD and Ouellette, BFF. Wiley.3rd edition. 2005.
•The NCBI handbook: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21101/

Programa de Pós-Graduação em Ciências Farmacêuticas.
Escola de Enfermagem e Farmácia
Prédio Administrativo da ESENFAR; Telefone: (82) 3214.1171; E-mail: ppgcfufal@gmail.com
Universidade Federal de Alagoas
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